Z formacji ludzkiej alumna łączy się w sposób ścisły formacja sumienia moralnego, rozumianego jako wrażliwość na wartości, dyspozycyjność wewnętrzna osoby, która ją uzdalnia do wyboru wartości i realizowania ich w życiu. Formacja sumienia związana jest również z wychowaniem alumna do wiernego, świadomego, wolnego i pełnego miłości do Chrystusa posłuszeństwa przyjętym zobowiązaniom moralnym. Kształtowanie sumienia uzdalnia do panowania nad sobą, do nabycia ducha ascezy, umartwienia i wyrzeczenia się tego, co nie jest konieczne, do poprawnego sposobu myślenia, ducha odpowiedzialnej pracy, refleksji, kontemplacji i wyciszenia.